应用化学研究所是山西大学一级研究单位，现有教职工21人，教授7人，副教授7人，各类大中型仪器100余台。发展的过程中，完成了一系列与农业生产有关的科研项目。特别是凭借在基础学科交叉结合的优势，以生物学和化学一级学科为主要依托，经过10余年艰苦努力，率先在国内推出了生物有机肥、复合生物肥、光合细菌叶面喷施剂、植物生长调节剂、微生物农药、植物源农药、土壤熟化剂、土壤修复剂、水质净化剂等产品，所有产品都在农业农村部获得登记认证。该所除了拥有X-射线衍射、气质联用色谱、核磁共振等大型分析检测设备外，还有全自动发酵罐、高效液相制备色谱、PCR仪、人工气候实验室、核酸蛋白检测仪等设备，并拥有一支以博士和教授为主的科研队伍，有相当雄厚的科研能力，并将为该项目提供产品和示范实施过程全方位的检测，再加上多年在绿色农产品栽培和生物化学方面的积累，为该项目的顺利完成奠定了技术和物质基础。

目前，研究所承担国家科技重大专项项目1项（子课题）；省级项目共计5项，其中山西省“1331工程”重点实验室-功能分子化学1项，山西省重点研发计划2项，山西省自然科学基金2项；横向项目共计3项。