绿色农业生态实验室：围绕绿色农业种植技术中所需要生产资料开展生物有机肥功能菌种的筛选、生物有机肥和生物叶面肥生产技术等方面的研究，建立绿色生态种植技术操作规程，并解决在推广应用中农机具配套的问题。通过对农业生态系统相关理论的创新、技术研发与实施，为农业生产、农业环境保护与生态建设提供科学依据和技术支撑。

生物催化实验室：不对称催化反应、催化机理、新催化剂及生产工艺，新型化合物的开发研究。

光效农业实验室：绿色生态农业与高光效研究、光合作用过程及其运转的调控作物、光能利用率与光合作用效率的研究。